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《生物信息学》复习要点

红色表示为重点内容,考试的比重较大.

第一章生物信息学引论

生物信息学；生物信息指哪些？contig；大规模测序的基本策略；功能基因组学；

生物信息学的应用有哪些？什么事件大大促进了生物信息学的发展？（HGP）；

生物信息学中最重要的贡献是什么（序列比对算法）？基因组测序完成的主要物

种（如人，水稻，大肠杆菌，酵母，拟南芥，果蝇等）；我国自主产权的基因组

测序有哪些?人类基因组计划的主要任务.

第二章生物信息学的生物学基础

碱性氨基酸和酸性氨基酸的种类；蛋白质二级结构有哪些？核苷酸序列中N表示

什么？遗传密码的基本特征是什么？真核生物基因的一般结构？转录本；启动

子(promoter)；EST；cDNA；内含子；外显子；UTR；TATA-box；ORF；起始密码

子；终止密码子；poly(A)加尾信号；TSS；中心法则；真核生物基因表达的调

控水平有哪些？

第三章生物数据库资源及其应用

三大核酸数据库有哪些？蛋白质序列数据库有哪些？蛋白质结构数据库有哪

些？掌握文献的PubMED检索规则；掌握核酸/蛋白质记录的检索规则；UniGene；

GEO;创建最早使用最广泛的蛋白质数据库是什么？(SWISSPROT和PIR)；

第四章序列分析

相似性；一致性；保守突变；同源性；序列比较的基本操作是什么？序列比较的

方法有哪些？序列比较的矩阵作图法；最长公共子序列；空位罚分；打分矩阵；

BLAST的全称；BLAST比对结果中图形颜色的意义以及score和E-value的含义；

FASTA格式；BLAST几种工具的含义及其用途；nr数据库；EST数据库；检索某

个基因序列的方法；如何通过生物信息学方法确定TSS？判断1个基因(EST)表

达部位或特性的生物信息学方法有哪些?

第五章系统发生分析

系统发生树；趋同进化；无根树；有根树；直系同源与旁系同源；系统发生树的

构建方法种类；非加权组平均法原理；最大简约法原理；信息位点；Bootstrap；

掌握非加权组平均法的构建方法；用ClustalX和MEGA软件构建进化树的流程是

什么？

第六章基因表达数据分析

基因芯片聚类分析图中红色和绿色代表的含义

第八章电子克隆技术

电子克隆（insilicocloning）；电子克隆的基本思路；电子克隆的操作步骤；

电子克隆的条件是什么？判断1个基因5'端是否完整的方法；Kozak规则是什

么？内含子的剪切规则？(GU..AG)

其他:

1)要了解BLAST的一般步骤和意义;

2)了解序列分析的基本内容和意义;

3)上机操作中涉及的重要网站和程序名称等（不需要记得网址）