苯丙氨酸解氨酶

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人车合一-莫西干发型

苯丙氨酸解氨酶
2023年3月10日发(作者:读书笔记昆虫记)

生物信息学China Journal of Bioinformatics 专论与综述

苯丙氨酸代谢途径关键酶:PAL、C4H、4CL研究新进展

李莉,赵越 ,马君兰

(东北农业大学生命科学学院,哈尔滨150030)

摘要:主要阐述了苯丙氨酸代谢途径tz-种关键酶:苯丙氨酸解氨酶(PAL)、肉桂酸4一羟基化酶(C4H)、4一香豆酸辅酶A连

接酶(4CL)的研究进展,希望能为研究植物次生代谢途径的研究工作者提供一些帮助。

关键词:次生代谢:苯丙氨酸解氨酶(PAL);肉桂酸4一羟基化酶(C4H);4一香豆酸辅酶A连接酶(4cL)

中图分类号:Q591 文献标识码:A 文章编号:1672—5565(200r7)一04—187—03

Recent progress on key enzymes:PAL、C4H、4CL

of phenylalanine metabolism pathway

U li,ZHAO Yue ,MA Jun—lan

(School of如 science,Northeast w £ 疵 ,Harbin150030,Otina)

:Phenylalanine metaho ̄sm pathway is one ofthe most important pathway of plant secc metaho ̄sm.That pathway be valued by

nlol ̄and nlol ̄pemons becau¥e its outcome have special biology function(such a8 isoflavone etc.). n1is text mainly elahorated¥onle recent

progress on three key em nes ofphenylalanine metabolism pathway:PAL、C4H、4 CL.We hope that our study Can slve the pemons who work-

ing on this project¥Ome helps.

Key Words:se(mdary船tab0lisn1;Ph唧心anil1e antmnialyas(P );Ciunmrmte4一hydrc ase(C4H);4-Carom-ate: ̄mzyme A llgase(4 )

植物的代谢分为初级代谢和次级代谢。植物的次级代谢 酸和氨生成L一苯丙氨酸(L--phen ̄alanine)。利用PAL这

有多条途径,苯丙氨酸代谢途径,从碳流的角度来看,是植物最 种逆向催化特性生产卜苯丙氨酸,成为当前生物化工领域

重要的次生代谢途径之一。在一个细胞中,有20%以上的代谢 研究与开发的热点。

会通过这条途径,该代谢途径的重要性在于:一切含苯丙烷骨架 1.1.2 PAL的基本特性

的物质都是由这一途径直接或间接生成。莽草酸途径产生的类P 己从许多植物组织中纯化和分离,不同来源的PAL结

黄酮、木质素等次生物质在植物抗逆境、抗病害上有非常重要的 构、分子量等均不尽相同,但总的来说其分子量约为240

作用。近年来,越来越多的科学工作者把眼光投放到苯丙氨酸 330kD,可解离为55 85kD的亚基,全酶为4个相同亚基构成的

代谢途径关键酶的研究,因为调节这些酶的表达活性,有效地调 四聚体。不同植物中PAL的氨基酸组成不同,如水稻中的PAL

节与之相应的次级代谢产物的生物合成,培育出适合人类生产 酸性成分少于/J、麦、玉米、马铃薯,而中性成分高于以上三种植

生活需要的植物新品种,如低木质素含量的造纸原料树种、高异 物。P虬没有单一的Km值,一般在10~ 10 之间。PAL的活

黄酮含量的大豆品种等。 性中心部位具有脱氢丙氨酰基的亲电中心。

1.1.3 PAL基因的结构

1 PAL、CAH、4CL研究的新进展

1.1 苯丙氨酸解氨酶( a1aI】il1e舭蚴衄ialyas,PAL)

1.1.1 PAL的作用

在次生代谢酶类中,PAL是研究较多、较早(Koukol,

1961)、最详尽的酶,它使植物的次生代谢与初生代谢联系起

来。该酶行使功能时不需要辅助因子参与,最适pH8.8(个

别大于9),它催化苯丙氨酸途径中的第一步反应,通过一个

非氧化脱氨基作用把苯丙氨酸转变成肉桂酸(cinnamln acid)

和氨;当过量的氨存在,且pH为10—10.5时,PAL催化肉桂

多数被子植物中,PAL亚基通常由小型基因家族编码

(一般2—5个成员),这些基因家族又可分成2或3个亚族。

该酶在所有的植物中都有。

1.1.4 PAL基因的表达调控

1.1.4.1内部调节

首先,发育调节,PAL酶活性随植物生长发育过程推进

而不断地变化。其次,PAL钝化因子和调节因子的调控,植

物体内有一种PAL的内源性抑制物质(PAL—inhibitor,PAL—

I)参与了PAL活性的调节。最后,末端产物调节,PAL的抑

制剂有许多种类,包括肉桂酸、对一香豆酸、以及某些氨基酸

收稿日期:2005—12—16;修回13期:2006—03—16

基金项目:黑龙江省教育厅资助课题(编号为10551024)

作者简介:李莉(1978一),女,在读硕士,研究方向:生物化学与分子生物学.E—mall:lily.mu695@sohu.(ggn

*通讯作者:赵越(197O一),女,硕士生导师。

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188 生 物 信 息 学 第5卷

如组氨酸、色氨酸等,另外不同来源的PAL对同一种类抑制

剂的敏感性不同。

1.1.4.2外部调节

PAL是一种诱导酶,可以受多种外界因素的诱导。各种

类型的低温、机械损伤、光(白光、蓝光、红光、紫外光)、病原

菌感染、毒素处理和昆虫取食都可以诱导PAL基因的表达,

这种诱导是在转录水平上的诱导,并具有组织特异性。生长

素(IAA)、激动素(BAP)和乙烯(乙烯利)也都可诱导植物PAL

基因的表达,刺激效应乙烯>IAA>BAP。也有研究表明,各

种因子对PAL的诱导存在着互作关系,如在切伤诱导甘薯

块根切片PAL活性增高时,L 、BAP、乙烯能使PAL的活性

进一步增加;且BAP的效应又可因被照光而增强。

另外,在苯丙烷代谢途径中,PAL催化反应曾被认为是

限速步骤,因为一些证据表明,抑制该酶及其基因表达会引

起苯丙酸的积累(Camm and Towers,1973)。然而Anterola等

(Anterola et al,2002)对松树悬浮细胞系的研究中发现,随着

培养基中苯丙酸浓度增高,会引起PAL,4CL等酶活性升高。

进一步研究发现,在光照条件下大豆PAL表达量比黑暗条

件下高,随着处理时间的延长,其mRNA的量和酶活性增加,

但是在次级代谢产物(如异黄酮)的积累水平上,这都表明在

这个过程中PAL可能为非限速酶。

1.2 CAH的研究进展

1.2.1 CAH的作用

CAH是第一个被鉴定的植物P450单加氧酶(Russell D

W,1967,1971),也是第一个既被克隆、又确定了功能的植物

P450酶,与其他P450相比,CAH具有在植物的各组织中均具

有很高活性的特点(Fahrendorf et al,1993,Mizutani M et al,

1993,Teutsch H G et al,1993)。该酶行使功能需氧且依赖

NADPH,它催化苯丙氨酸途径的第二步反应,同时是也该途

径的第一个氧化反应,在肉桂酸的对位点上催化位置特异性

的羟化反应,将反式肉桂酸催化生成对一香豆酸。

1.2.2 CAH基因的结构

动物中P450的结构与表达已经有较多的了解。然而植

物P450的功能及表达特征却知道得不多。

目前至少有20种CAH基因从植物中分离。同PAL基因

一样,CAH基因拷贝数在不同植物中也是不同的。苜蓿有两

个CAH基因,豌豆(Hsumsafivum)只有一个拷贝,绿豆和长春

花(Catharanthusroseus)的CAH是由多个拷贝组成的一个小的

基因家族。这些基因编码的氨基酸序列同源性普遍较高约

85%。但其中来自玉米和法国菜豆的两个序列例外。同源性

仅达60%(Potter et al,1995;Nedelkina et al,1999)。另外,对已

发表的CAH启动子序列进行比较,发现启动子大约1.1kb

(Kawai et al,1996)

1.2.3 CAH基因的表达调控

CAH的表达与植物的木质化进程密切相关(Chapple。

1998)。欧芹中CAH表达模式研究结果显示,该酶在维管束

发达的花梗中表达丰富,在幼叶和老叶中不表达(Koopmann

et al,1999);拟南芥中CAH基因于正在木质化的细胞中表达

最强(Bell—Lelong et al,1997)。

人们在对CAH功能的研究中发现,在植物的生长发育

过程中以及各种外界因子,如激发子、真菌感染、机械损伤及

化学诱导子等刺激下,其编码基因mRNA积累水平的变化趋

势与PAL趋于一致。

1.3 4CL的研究进展

1.3.1 4CL的作用

4CL作用于苯丙酸途径中最后一步反应,催化各种羟基

肉桂酸生成相应的硫酯,这些硫酯处于苯丙酸代谢途径和各

种末端产物特异合成途径的分支点。以前认为4CL主要以

香豆酸、咖啡酸和阿魏酸为催化底物,不以芥子酸为底物

(Ehlting et al,1999;Hu et al,1999;Allina et al,1998),由此推测

s木质素的合成途径可能并不经过芥子酸(魏建华和宋艳

茹,2001)。然而Lindermayr等(Lindermayr et al,2002)从大豆

中分离了一种4CL同工酶,它芥子酸为底物催化分成芥子酞

一辅酶A。另外Yamauehi等(Yamauehi et al,2003)以四种植

物为研究对象,进行放射性同位素示踪实验,结果表明洋槐

和夹竹桃中的芥子酸可最终生成芥子醇,而在拟南芥和木兰

中却不能。这一结果揭示出被子植物中4CL催化底物特异

性因植物种类而异。

1.3.2 4CL基因的结构

Voo等(1995)从火炬松木质部中克隆出了一个4CI.c.

DNA,编码64kI)多肽;l-Iaufe等从荷兰芹中分离出的4CL1基

因及旧动子,可在植物茎中特异表达,现已将4CL基因从大

豆、松树、欧芹、杨树等几种植物中克隆出来,对所有已知植

物4CL的系统树分析表明,4CL1属于一个簇,而4CL2则属

于另外一个簇。

1.3.3 4CL同功酶的研究

4CL通常以基因家族形式存在,其同工酶具有不同的底

物特异性和时空表达特性,具有各自的生理功能。在颤杨

中,Pt4CL1参与木质素的生物合成途径,Pt4CL2则参与类黄

酮的形成(Hu et al,1998);在大豆中存在四个同工酶,

Gm4CL1和Gm4CL2参与植物的生长和发育,Gm4CI.3和

Gm4CIA则对外界环境因子产生响应(Lindermayr et al,2002)。

2应用前景及分子生物学展望

2.1应用前景

由于生产和保健的需要,植物抗病育种,生物活性成分

成为现代生物技术的焦点之一。开展对PAL、C4H、4CL酶基

因作用机制,表在部位和时空表达模式的研究,将再利于我

们进一步研究它们的基因表达调控机理、改变表达活性。一

方面,提高植物抗性,既可减少生产上经济损失,又可减少农

药等对人类健康以及生态环境的损害;另一方面,富集特定

目的次生代谢产物,经过苯丙烷代谢途径的许多次生代谢产

物是天然的、对许多重大疾病有独特疗效的活性成分。在医

疗保健具有不可替代的作用(如异黄酮等)。另外,可通过调

控酚类物质代谢影响色泽发育,因此有理由相信,利用分子

生物学技术能大规模的改变花及果实的色泽,从而改良植物

的品质,提高经济效宜。

2.2分子生物学展望

随着分子生物学尤其是基因测序技术的不断发展,更多

不同来源的P^JL、CAH、4CL基因序列将被克隆和测序,通过

分别与已知基因序列的比较分析,能够从分子水平上揭示它

们的结构特点,从而为更好的改造这些基因,改变它们的表

达活性提供更多的基础资料。对于涉及多个基因表达的植

物次生代谢,同时增强多个基因的协同表达是提高次生代谢

物产量所必需的。人们在对这三种酶编码基因的启动于序

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第4期 李 莉,等:苯丙氨酸代谢途径关键酶:PAL、C4H、4CL研究新进展 189

列进行分析发现,它们的启动子序列中具有一些共同的顺式

作用元件(Logemann et al,1995;Bell—lelong et al,1997;Mizutani

et al,1997),这为实现增强多个基因的协同表达提供了可

行性。

总之,进一步开展对PAL、CAH、4CL酶基因作用机制、表

达部位和时空表达模式的研究,将利于我们进一步研究它们

的基因表达调控机理,并用之转化植物使之按照人们的意愿

在转基因植物中大量持久地表达,从而增强植物对病害的广

谱持久抗性,提高特定次生代谢产物(比如大豆异黄酮)的含

量等,更好地为人类服务,这也将是今后研究的焦点之一。

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