SNPs

SNP的定义和研究意义

定义

概念：单核苷酸多态性（SingleNucleotidePolymorphisms，SNPs），指单个核苷

酸碱基的改变，包括置换、颠换、缺失和插入，导致的核酸序列的多态性。在不同

个体的同一条染色体或同一位点的核苷酸序列中，绝大多数核苷酸序列一致而只有

一个碱基不同的现象，这就是SNP。

分类：绝大多数SNP为双等位型(bi-alleles),或称二态,即一对同源染色体上同一

位点二个碱基对发生变异的状态,它们在人群中可以有3种基因型,如上述例子中可

形成两条染色体均是T-A碱基对的纯合子(homozygote)、均是G-C碱基对的纯合子

和一条染色体该位点为T-A碱基对而另一条染色体该位点为G-C碱基对的杂合子

(heterozygote)。按核苷酸置换的类型,SNP包含有G/A,C/T,G/T,A/C,A/T和

G/C六种,其中G/A和e/T型转换最常见,各占约30%,其余四种颠换各占约10%。

分布：约有50%的SNP分布于重复序列区,其余分布于重复序列以外的非编码序列区

和编码基因,分布在非编码序列区的有基因外SNP(perigenicSNP,pSNP)和基因间

SNPCintergenicSNP,iSNP),分布在编码区的称为编码区SNP(coding-regionSNP,

cSNP)。从基因进化的角度考虑,由于基因编码序列更加保守,cSNP似乎可提供更多

的生物学信息。目前已在dbSNP存放的人基因组SNP数目已超过900万个

([url]http://snp.[/url]/)。SNP是人基因组内最为广泛的遗传变异,

它也是体现人群中个体差异的DNA序列变化中最基本和最常见的形式,任何两个个

体之间所存在的基因组序列差异仅为1/1000,他们的序列同源性为99.9%,而人DNA

变异的90%是由SNP贡献的。

意义：由于其在染色体上的分布具有相对均一性而密度又远高于微卫星DNA位点,

且其二态性较STR更易于实现快速高通量自动化检测,故被认为是最具应用潜力的

新一代遗传标志物,相信其在后基因组时代针对人类复杂性状疾病和药物遗传学研

究中将起到越来越重要的作用。在未来的研究中,建立和积累人类疾病易感基因和疾

病表型与SNP或SNP型关系的资料,将会有助于我们发现确定人类复杂性状遗传病的

易感基因。

SNPs的研究意义

1.具有已知性、可遗传性、可检测性，用于疾病基因的定位、克隆和鉴定。寻找疾

病相关的突变位点，发展疾病预防策略。

2.研究SNPs本身对机体的影响，尤其是疾病的易感性、个性化医疗。通过对药物靶

点个体差异性分析，个性化药物、方法治疗。SNP可以作为新的“遗传标志”,人体

许多表型差异、对药物或疾病的易感性等等都可能与SNP有关

3.法医学研究。人类基因组是一个结构十分稳定的体系，同时又是一个变异的体系。

在长期的进化过程中，基因组DNA的序列不断发生变异。这些变异有些被保存下来，

导致了不同种族、群体和个体间基因组的差异和多态性，除同卵双生子外，没有两

个个体基因组是完全相同的。

4.器官移植中供体/受体配对分析。预测启动子SNPs位点与转录因子结合的改变,

编码区SNPs对蛋白质的空间结构,生物功能的影响等

5.人类基因组计划。人类基因组单体型图谱的逐渐绘制完成,提供了详尽的人类DNA

序列的变异信息,对人类个体遗传背景的研究提供了强大的机遇和挑战。